醫學資訊是一門使用系統與分析工具，來處理醫療資料，根據醫療過程中的知識與經驗做理論性及實際性的探討。在本學程中，規劃以下發展重點：
一、醫院資訊系統：
研究及開發醫療院所於臨床作業、教學研究、與行政管理之資訊系統。應用暨研究方向包含整合式醫院資訊系統與管理、電子病歷、醫學資訊標準、醫學數位內容網路學習等。
二、健康照護系統：
研究及開發健康照護使用之資訊系統。應用暨研究方向包含遠距醫療、雲端健康照護等。建構醫療決策及輔助診斷所需之智慧型電腦輔助資訊系統。應用暨研究方向包含生醫訊號處理、醫學影像處理與識別、醫療決策支援系統、人工智慧等。
三、醫學資訊創新應用：
因應現今社會的變化，研發時下所需要的醫學資訊應用。將傳統複雜的醫學資訊系統改進，並利用行動裝置或雲端系統加以整合，以開發出各項創新應用。例如在病人看護部分，開發適合全年齡使用者的每日檢查報表，以人機互動原理設計自我檢查系統。從醫學資訊去預測病患的身理狀況等，例如：遠距複診系統，個人電子病歷檢查系統。以創新應用結合醫學知識發展出全新的醫學資訊框架。